231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2274 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2274  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
213 aa  418  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  54.33 
 
 
221 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  51.61 
 
 
218 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  51.61 
 
 
218 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  51.61 
 
 
218 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  51.08 
 
 
218 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  48.08 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  51.35 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  48.31 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.31 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  48.31 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  48.31 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  48.31 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.31 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  48 
 
 
217 aa  181  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.31 
 
 
256 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  48.92 
 
 
218 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  48.92 
 
 
218 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  45.93 
 
 
218 aa  171  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  49.71 
 
 
217 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  44.98 
 
 
218 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  44.98 
 
 
218 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  42.79 
 
 
218 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  44.02 
 
 
218 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  43.54 
 
 
218 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  42.79 
 
 
229 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  43.54 
 
 
218 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  43.54 
 
 
218 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  43.54 
 
 
218 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  41.55 
 
 
235 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  40.67 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  45.45 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  40.19 
 
 
219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  39.61 
 
 
235 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  38.16 
 
 
218 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  43.06 
 
 
215 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  41.35 
 
 
218 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  40.29 
 
 
222 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  47.21 
 
 
216 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  46.7 
 
 
216 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  42.58 
 
 
218 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  42.58 
 
 
218 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  40.87 
 
 
218 aa  157  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 
222 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.65 
 
 
223 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  40.91 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  41.62 
 
 
215 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  40.57 
 
 
228 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  40.61 
 
 
215 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  41.43 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  40.61 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  36.67 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  40.93 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  38.89 
 
 
231 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  44.38 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  38.21 
 
 
242 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.88 
 
 
242 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  40.32 
 
 
220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  30.33 
 
 
243 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  40.54 
 
 
233 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  40.19 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  43.66 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  35.24 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  42.72 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  43.09 
 
 
239 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  40.41 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  33.84 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  40.55 
 
 
225 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  32.71 
 
 
221 aa  124  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  39.18 
 
 
227 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  37.17 
 
 
243 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  38.89 
 
 
225 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  38.34 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.04 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  45.4 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  43.02 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  36.84 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  31.84 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  38.14 
 
 
253 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  32.27 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  32.13 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  35.88 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  34.67 
 
 
237 aa  118  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  30.94 
 
 
246 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  42.2 
 
 
203 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  45.52 
 
 
240 aa  117  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  41.54 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  34.87 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  37.56 
 
 
244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  37.09 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  30.49 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  33.17 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.36 
 
 
237 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>