More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1336 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.399223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3743  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4625  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5679  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  46.85 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.3 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0274  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  42.53 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3519  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683413  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 258 aa  184  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  48.2 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  42.08 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.7 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.49 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3752  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4616  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.055256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  45.25 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5688  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0612982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0311  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  44.2 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3241  two-component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.582303  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3977  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1241  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1972  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2102  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.1 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5713  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  43.24 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  43.89 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  41.1 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3447  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 277 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679069  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  44.3 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.05 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  41.26 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 240 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>