More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0448 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0448  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 456 aa  892    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.807242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  43.18 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  42.86 
 
 		 463 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  42.86 
 
 		 463 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  42.86 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  42.41 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  42.19 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  44.81 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  44.81 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  44.81 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  44.81 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  44.81 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  44.81 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  42.34 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  44.81 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  41.61 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  41.85 
 
 		 463 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  41.85 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  41.67 
 
 		 463 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 460 aa  342  8e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  40.49 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  40.27 
 
 		 463 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  42.09 
 
 		 466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  42.26 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  42.09 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  42.09 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  41.32 
 
 		 461 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  42.03 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  42.03 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  42.03 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  42.03 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  41.32 
 
 		 461 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  44.52 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  41.48 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6620  amino acid permease-associated region  45.11 
 
 		 484 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.693405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  42.13 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  40.04 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 472 aa  329  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  41.7 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  42.73 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  39.64 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  43.67 
 
 		 606 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  40.91 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  39.73 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  39.95 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  39.5 
 
 		 487 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  41.87 
 
 		 472 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  41.41 
 
 		 463 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  41.19 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  41.19 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  39.91 
 
 		 480 aa  315  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  39.2 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  39.2 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  39.2 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  39.2 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  41.01 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  37.95 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  40.58 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2523  amino acid permease-associated region  43.02 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  41.22 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4525  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.411369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2038  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 470 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  41.88 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2188  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 		 491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000662916  hitchhiker  0.000260404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2543  amino acid ABC transporter permease  39.21 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0431573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3171  amino acid permease-associated region  39.21 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.12607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  42.34 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  41.86 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  42.34 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6223  amino acid permease-associated region  41.46 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  38.16 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  34.58 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  34.58 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  34.44 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  34.44 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  39.11 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  34.44 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01580  gamma-aminobutyrate permease  41.02 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683743  normal  0.83882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0205  gamma-aminobutyrate permease  41.02 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  34.44 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  34.44 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  34.44 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  34.58 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4364  amino acid permease-associated region  39.72 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  37.39 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  37.39 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  37.39 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  37.39 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  33.55 
 
 		 456 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2002  amino acid transporter  40.79 
 
 		 473 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  35.32 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>