58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0360 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0360  protein of unknown function DUF1009  100 
 
 
282 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10118  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2449  hypothetical protein  59.93 
 
 
287 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4427  hypothetical protein  46.89 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0476773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1598  hypothetical protein  46.1 
 
 
286 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.653331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2845  hypothetical protein  41.82 
 
 
285 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3256  protein of unknown function DUF1009  41.79 
 
 
285 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2792  hypothetical protein  42.12 
 
 
283 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0568081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3183  hypothetical protein  45.42 
 
 
291 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2448  hypothetical protein  40.15 
 
 
284 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1706  hypothetical protein  40.81 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.349467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1847  hypothetical protein  40.81 
 
 
288 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.730915  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2816  hypothetical protein  40.81 
 
 
285 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4505  hypothetical protein  39.86 
 
 
285 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1125  hypothetical protein  40.81 
 
 
271 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.33509  decreased coverage  0.00103642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1142  hypothetical protein  40.88 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1375  hypothetical protein  39.29 
 
 
288 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000871979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1145  protein of unknown function DUF1009  39.26 
 
 
268 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1214  protein of unknown function DUF1009  39.26 
 
 
268 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2040  hypothetical protein  39.56 
 
 
299 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.229443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1086  hypothetical protein  39.26 
 
 
268 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1852  hypothetical protein  36.94 
 
 
278 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000781514  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0897  hypothetical protein  39.62 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1594  protein of unknown function DUF1009  39.02 
 
 
293 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.983213  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3376  protein of unknown function DUF1009  35.32 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2449  hypothetical protein  41.44 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  hitchhiker  0.00174485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1787  protein of unknown function DUF1009  38.52 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1150  hypothetical protein  37.86 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1108  hypothetical protein  37.63 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3002  protein of unknown function DUF1009  37.94 
 
 
281 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2512  hypothetical protein  37.5 
 
 
290 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101135  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0593  hypothetical protein  34.57 
 
 
290 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0138266  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3908  hypothetical protein  41.42 
 
 
265 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0741095  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5219  protein of unknown function DUF1009  48.53 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2839  hypothetical protein  35.58 
 
 
273 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2226  protein of unknown function DUF1009  34.31 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.212193  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2359  protein of unknown function DUF1009  34.16 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1527  protein of unknown function DUF1009  41.22 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1392  hypothetical protein  38.75 
 
 
297 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2142  hypothetical protein  40.81 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  32.58 
 
 
649 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3435  hypothetical protein  39.43 
 
 
287 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.853398  normal  0.369907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1503  conserved hypothetical protein DUF1009  39.3 
 
 
265 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4677  hypothetical protein  43.64 
 
 
282 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.299114  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0644  hypothetical protein  41.22 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650994  normal  0.611382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5142  protein of unknown function DUF1009  43.27 
 
 
282 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  0.0362287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4554  hypothetical protein  32.49 
 
 
301 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.0581006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2350  protein of unknown function DUF1009  29.15 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2715  hypothetical protein  40.07 
 
 
273 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1373  hypothetical protein  40.3 
 
 
273 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.848143  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0884  protein of unknown function DUF1009  32.03 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0371  protein of unknown function DUF1009  27.21 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0143196  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1403  hypothetical protein  36.7 
 
 
262 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408064  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1393  hypothetical protein  38.29 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78507  hitchhiker  0.00530667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17540  hypothetical protein  30.69 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1287  protein of unknown function DUF1009  30.88 
 
 
269 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0767794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0079  hypothetical protein  28.31 
 
 
273 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000676342  hitchhiker  0.00000000000219127 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1010  protein of unknown function DUF1009  28.79 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00304045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3873  hypothetical protein  31.87 
 
 
281 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.429993  normal  0.0170553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>