291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4623 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0381  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4236  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0742  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1403  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1894  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4623  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0223543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4081  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  58.42 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  58.42 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  58.42 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  57.55 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  57.55 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  59.41 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  59.41 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  53.7 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  58.43 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  54.26 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20920  Transposase  49 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13980  Transposase  44.66 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  43.69 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  43.69 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  44.34 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  43.4 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  41.58 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  45.54 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  45.54 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  45.54 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  45.54 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  41.51 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  41.35 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  40.57 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  40.57 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5972  transposase IS3/IS911 family protein  42.72 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.540441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2587  hypothetical protein  44.74 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000140598  hitchhiker  0.000388749 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  39.25 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  39.25 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  38.61 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  38.61 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  38.46 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  36.79 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  36.79 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  36.79 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  39.6 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  42.27 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  36.19 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  36.19 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  36.19 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2810  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.978758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4664  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3613  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3431  transposase IS3/IS911 family protein  38.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>