109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4278 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4278  protein of unknown function DUF488  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3653  protein of unknown function DUF488  65.49 
 
 
125 aa  159  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000515304  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4868  hypothetical protein  64.91 
 
 
120 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3373  hypothetical protein  57.14 
 
 
117 aa  137  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21720  hypothetical protein  53.91 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  53.1 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0520  hypothetical protein  56.25 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  53.57 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3257  hypothetical protein  48.31 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.544396  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  50.45 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4646  hypothetical protein  50.89 
 
 
111 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0651  hypothetical protein  44.54 
 
 
121 aa  110  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.249398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13090  hypothetical protein  50.45 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00020399  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  52.25 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0222  hypothetical protein  48.67 
 
 
118 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0228  hypothetical protein  48.67 
 
 
118 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2562  hypothetical protein  43.36 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0361226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0032  protein of unknown function DUF488  52.63 
 
 
117 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  49.09 
 
 
163 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  45.95 
 
 
117 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1515  protein of unknown function DUF488  48.31 
 
 
127 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.933464  normal  0.210794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  53.68 
 
 
129 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1197  protein of unknown function DUF488  50 
 
 
116 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.800748  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3473  hypothetical protein  45.22 
 
 
118 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0478  hypothetical protein  44.92 
 
 
116 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  49.55 
 
 
124 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0416  hypothetical protein  44.92 
 
 
116 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0551  protein of unknown function DUF488  54.64 
 
 
126 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  46.43 
 
 
117 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0871  hypothetical protein  47.32 
 
 
129 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2397  protein of unknown function DUF488  46.67 
 
 
114 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000131309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  46.02 
 
 
116 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  45.05 
 
 
120 aa  101  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3152  hypothetical protein  50.44 
 
 
123 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  45.54 
 
 
121 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  47.79 
 
 
120 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  42.74 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1802  hypothetical protein  44.64 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5031  hypothetical protein  62.86 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0289  hypothetical protein  47.96 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0136906 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  44.64 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0156  hypothetical protein  54.05 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2090  hypothetical protein  44.25 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8395  protein of unknown function DUF488  48.72 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313656  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1448  hypothetical protein  41.07 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.790697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2555  hypothetical protein  48.57 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1072  protein of unknown function DUF488  44.55 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  42.48 
 
 
171 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3092  hypothetical protein  45.13 
 
 
120 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1662  hypothetical protein  44.55 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  45.13 
 
 
115 aa  93.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50620  hypothetical protein  45.54 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3731  hypothetical protein  42.34 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.704488  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4313  hypothetical protein  46.43 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0415  protein of unknown function DUF488  50 
 
 
130 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0239  protein of unknown function DUF488  45.95 
 
 
120 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0661  hypothetical protein  41.74 
 
 
115 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0440  protein of unknown function DUF488  42.34 
 
 
114 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0782  protein of unknown function DUF488  42.61 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  45.36 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3243  hypothetical protein  46.43 
 
 
134 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2045  hypothetical protein  47.71 
 
 
115 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01761  hypothetical protein  47.71 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2016  hypothetical protein  47.71 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0695  hypothetical protein  43.86 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01749  hypothetical protein  47.71 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.464208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2516  hypothetical protein  46.79 
 
 
115 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.826147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1878  hypothetical protein  45.87 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1841  hypothetical protein  45.87 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527952  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0364  hypothetical protein  44.55 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1399  hypothetical protein  45.87 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1369  hypothetical protein  45.05 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.623897 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1407  protein of unknown function DUF488  41.07 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.193708  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4425  hypothetical protein  44.33 
 
 
123 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.987297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  45.05 
 
 
115 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1385  hypothetical protein  45.05 
 
 
115 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1402  hypothetical protein  45.05 
 
 
115 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.219828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1851  protein of unknown function DUF488  44.95 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  43.24 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6029  protein of unknown function DUF488  43.59 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  45.05 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0493  protein of unknown function DUF488  41.96 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  42.86 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  41.59 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  37.29 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  36.44 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0088  hypothetical protein  37.29 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0412988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1562  hypothetical protein  39.02 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3381  protein of unknown function DUF488  40.52 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0248  hypothetical protein  36.61 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000242831  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0525  hypothetical protein  46.9 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0982  protein of unknown function DUF488  45.87 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0138018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  41.07 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3675  hypothetical protein  43.75 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020732  hitchhiker  0.000000942078 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0858  hypothetical protein  45.87 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4102  hypothetical protein  46.36 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.0548899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0623  hypothetical protein  41.59 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278191 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  42.71 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1762  hypothetical protein  45.45 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>