More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4220 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4220  UspA domain protein  100 
 
 		 289 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  42.12 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  42.12 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  38.21 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  38.21 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  38.21 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  40.13 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  41.44 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  39.12 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  38.64 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  36.9 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  39.33 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.8 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.44 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  39.31 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  43.4 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  41.11 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  38.36 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.11 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  38.19 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.01 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  37.72 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.59 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.62 
 
 		 303 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  36.81 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  38.49 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  35.03 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.21 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  35.59 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.42 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  40.73 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.27 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  40.35 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  40.88 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.21 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.75 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.74 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.3 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.37 
 
 		 310 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.46 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.79 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.67 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  40.39 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.47 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  43.89 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.99 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  34.95 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  41.7 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.41 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.86 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.31 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.28 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.55 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  41.64 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  37.32 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  32.41 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  38.78 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  34.65 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  37.05 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.81 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  38.91 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  41.11 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  32.78 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>