More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3992 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3992  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
515 aa  1064    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  44.24 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2009  aldehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
493 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1765  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
496 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
487 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
510 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1831  aldehyde dehydrogenase  49.49 
 
 
418 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1784  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
413 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
476 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  40.09 
 
 
479 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  40.18 
 
 
479 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
484 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  38.64 
 
 
483 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  39.55 
 
 
472 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  38.62 
 
 
472 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  39.82 
 
 
473 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
472 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
475 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
479 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
477 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  38.04 
 
 
477 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  34.29 
 
 
475 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
481 aa  309  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  34.84 
 
 
474 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  37.69 
 
 
477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
474 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
474 aa  306  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  34.84 
 
 
474 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
475 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
476 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 
476 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  36.95 
 
 
477 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 
476 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
477 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 
474 aa  300  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  35.2 
 
 
476 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.45 
 
 
475 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  36.63 
 
 
476 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
474 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
473 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
491 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  33.92 
 
 
474 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
480 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  35.39 
 
 
481 aa  294  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
474 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
480 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
480 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  36.07 
 
 
496 aa  294  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
480 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  35.27 
 
 
474 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
474 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  34.91 
 
 
479 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
472 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  34.29 
 
 
480 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
473 aa  292  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  34.51 
 
 
480 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  35.32 
 
 
472 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
474 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  33.84 
 
 
475 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0661  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 
465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
480 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
483 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
490 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
474 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.18 
 
 
472 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  32.86 
 
 
473 aa  287  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  34.72 
 
 
479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3496  Aldehyde Dehydrogenase  34.42 
 
 
475 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3791  aldehyde dehydrogenase  39.73 
 
 
477 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  34.21 
 
 
472 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
498 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 
480 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  35.86 
 
 
485 aa  279  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  34.45 
 
 
470 aa  277  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2120  aldehyde dehydrogenase  35.99 
 
 
474 aa  273  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.536292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  36.07 
 
 
478 aa  272  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  33.2 
 
 
486 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  35.1 
 
 
460 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  33.78 
 
 
466 aa  270  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
465 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  34.27 
 
 
484 aa  266  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  33.11 
 
 
470 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5303  aldehyde dehydrogenase  34.45 
 
 
485 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
467 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  32.56 
 
 
483 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>