More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3558 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2513  chaperonin GroEL  64.6 
 
 		 549 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3558  chaperonin GroEL  100 
 
 		 549 aa  1080    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00358723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  54.68 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  54.02 
 
 		 541 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  51.86 
 
 		 538 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  51.95 
 
 		 539 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  53.95 
 
 		 544 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  52.23 
 
 		 538 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  50.19 
 
 		 536 aa  537  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  54.3 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  53.82 
 
 		 544 aa  535  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  54.16 
 
 		 540 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  53.07 
 
 		 541 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  51.6 
 
 		 544 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  54.84 
 
 		 541 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  53.92 
 
 		 541 aa  535  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  53.15 
 
 		 540 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 542 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  51.98 
 
 		 544 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  53.07 
 
 		 539 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  52.96 
 
 		 540 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  53.07 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  51.82 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  52.04 
 
 		 540 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  52.72 
 
 		 540 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  53.26 
 
 		 541 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  52.78 
 
 		 537 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  52.96 
 
 		 543 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  50.86 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  53.54 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  52.4 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  52.03 
 
 		 541 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  50.67 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  52.32 
 
 		 541 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  51.66 
 
 		 541 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  53.46 
 
 		 542 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  52.77 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  52.96 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  50.1 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  51.25 
 
 		 548 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  50.09 
 
 		 538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  51.45 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  50.93 
 
 		 540 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  53.42 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  52.58 
 
 		 545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  50.96 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  52.13 
 
 		 541 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  50.75 
 
 		 539 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  51.31 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  52.59 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  51.02 
 
 		 541 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  51.78 
 
 		 544 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  49.9 
 
 		 538 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  49.9 
 
 		 538 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  52.19 
 
 		 527 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  51.82 
 
 		 547 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  52.01 
 
 		 542 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  52.77 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  51.29 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  51.04 
 
 		 540 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  51.29 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  48.66 
 
 		 540 aa  508  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  50.76 
 
 		 536 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  51.63 
 
 		 545 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  52.69 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  51.29 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  49.33 
 
 		 538 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  50.84 
 
 		 540 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  48.75 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  51.05 
 
 		 541 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  52.85 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  48.75 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  51.5 
 
 		 542 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  47.95 
 
 		 543 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  52.2 
 
 		 541 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  51.43 
 
 		 541 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  48.75 
 
 		 541 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  50.28 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  50.28 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0184  chaperonin GroEL  49.04 
 
 		 545 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  49.25 
 
 		 543 aa  505  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  50.48 
 
 		 542 aa  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  51.72 
 
 		 541 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  49.43 
 
 		 544 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  51.4 
 
 		 542 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  51.43 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  50.19 
 
 		 548 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  48.03 
 
 		 544 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  50.18 
 
 		 543 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  48.33 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  49.62 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  50.86 
 
 		 540 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  49.62 
 
 		 547 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>