More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1969 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  78.57 
 
 
271 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  76.65 
 
 
280 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  76.65 
 
 
280 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  76.26 
 
 
280 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  76.08 
 
 
278 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  75.39 
 
 
281 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  70.66 
 
 
264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  66.54 
 
 
301 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  62.93 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  61.96 
 
 
312 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  65.6 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  60.39 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  60.94 
 
 
293 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  65.02 
 
 
265 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  61.04 
 
 
277 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  63.1 
 
 
300 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  59.84 
 
 
270 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  59.11 
 
 
282 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  57.42 
 
 
268 aa  278  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  58.63 
 
 
263 aa  278  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  59.84 
 
 
282 aa  274  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  58.96 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  61.26 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  56.4 
 
 
277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  54.58 
 
 
295 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  55.73 
 
 
285 aa  262  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  55.6 
 
 
276 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  56.86 
 
 
268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  57.65 
 
 
268 aa  258  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  58.46 
 
 
292 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  42.69 
 
 
264 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  39.76 
 
 
267 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  39.13 
 
 
269 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  38.98 
 
 
269 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  38.98 
 
 
269 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  38.98 
 
 
269 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  39.13 
 
 
269 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  38.98 
 
 
269 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  38.98 
 
 
267 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  45.85 
 
 
272 aa  198  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  38.98 
 
 
269 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  38.98 
 
 
269 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  38.58 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  41.73 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  45.06 
 
 
276 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  45.28 
 
 
272 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  42.69 
 
 
288 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  43.48 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  43.08 
 
 
275 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  41.34 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  42.52 
 
 
278 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  44.9 
 
 
276 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  36.63 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  37.94 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  41.96 
 
 
281 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  44.49 
 
 
281 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.97 
 
 
295 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  40.33 
 
 
272 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  40.57 
 
 
272 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  40.16 
 
 
258 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  41.7 
 
 
303 aa  168  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  36.99 
 
 
280 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  42.17 
 
 
276 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  36.99 
 
 
280 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  37.3 
 
 
271 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  43.14 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  43.14 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  40.61 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  41.22 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  41.96 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  41.5 
 
 
276 aa  162  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  38.65 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  37.1 
 
 
291 aa  161  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  39.22 
 
 
268 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  39.06 
 
 
283 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  40.6 
 
 
270 aa  158  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  37.55 
 
 
271 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  38.55 
 
 
276 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  38.96 
 
 
275 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  38.84 
 
 
272 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  39.69 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  39.76 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  39.76 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  38.71 
 
 
275 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  39.02 
 
 
265 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  42.75 
 
 
259 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  38.4 
 
 
273 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  38.55 
 
 
276 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40 
 
 
289 aa  154  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  38.55 
 
 
276 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  38.55 
 
 
276 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  34.8 
 
 
264 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  39.75 
 
 
288 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  37.14 
 
 
267 aa  152  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  33.99 
 
 
264 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  38.98 
 
 
265 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  31.84 
 
 
260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  36.73 
 
 
266 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  33.2 
 
 
267 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>