More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1767 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1767  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  59.71 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  55.91 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  55.2 
 
 		 274 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  52.86 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  51.6 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  53.17 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1211  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.45 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1228  exodeoxyribonuclease III Xth  57.45 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1238  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  50.53 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  51.25 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  47.69 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2985  exodeoxyribonuclease III Xth  49.1 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  46.32 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000488572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27900  exodeoxyribonuclease III Xth  45.52 
 
 		 266 aa  224  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408548  normal  0.79978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21350  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0698  exodeoxyribonuclease III Xth  42.86 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3979  exodeoxyribonuclease III Xth  44.56 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1121  exodeoxyribonuclease III Xth  44.56 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0757  exodeoxyribonuclease III Xth  44.48 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2498  exodeoxyribonuclease III Xth  47.16 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.65 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10160  exodeoxyribonuclease III  41.12 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  40.07 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04750  exodeoxyribonuclease III  41.4 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.989341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  39.86 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  39.65 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  37.72 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  41.58 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  37.91 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.01 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30930  exodeoxyribonuclease III Xth  40.88 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  38.99 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  37.91 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  39.78 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  39.29 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  39.29 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  39.57 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  41.01 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  39.78 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0258  exonuclease III  39.67 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.07 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  38.99 
 
 		 258 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  38.79 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  38.27 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  39.21 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  37.77 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.77 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  37.77 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  39.57 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  38.27 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  38.99 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  39.07 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  37.68 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  37.68 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  37.81 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0490  putative exodeoxyribonuclease III  37.33 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2277  exodeoxyribonuclease III Xth  38.93 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  36.2 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.01 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  37.63 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  37.46 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  32.83 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  36.59 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  36.26 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  34.05 
 
 		 260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  34.05 
 
 		 260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  38.13 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.94 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.61 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  35.99 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.45 
 
 		 254 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  35.38 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.29 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0180  exodeoxyribonuclease III Xth  36.33 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  hitchhiker  0.00000710685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02870  catabolite repression control protein; Crc  36.1 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  32.84 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  35.36 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  33.09 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5200  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5292  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.328538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5341  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11599  hitchhiker  0.00893933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5545  exodeoxyribonuclease III xth  35.02 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4384  exodeoxyribonuclease III Xth  34.78 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465503  normal  0.053083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  34.49 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70390  catabolite repression control protein  34.78 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6108  catabolite repression control protein  34.78 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0215  exodeoxyribonuclease III xth  33.7 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  31.64 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  32.96 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>