219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1434 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1434  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
345 aa  707    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  54.55 
 
 
352 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7332  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.24 
 
 
345 aa  335  7.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000215646  hitchhiker  0.0000000024237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.24 
 
 
296 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  36.34 
 
 
330 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4235  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.19 
 
 
459 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.01 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  30.51 
 
 
373 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2446  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.94 
 
 
379 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.370845  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.65 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.41 
 
 
370 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.67 
 
 
356 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.57 
 
 
368 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.86 
 
 
368 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  28.24 
 
 
365 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  30.38 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  29.97 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.74 
 
 
359 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.11 
 
 
379 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  29.68 
 
 
378 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.95 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.06 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.91 
 
 
305 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  32.76 
 
 
388 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0560  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.89 
 
 
323 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0571  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 
361 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  25.52 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.78 
 
 
292 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.92 
 
 
293 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.47 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.81 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.48 
 
 
293 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  26.02 
 
 
301 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.04 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.3 
 
 
259 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.08 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.34 
 
 
284 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.93 
 
 
282 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  25.93 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.09 
 
 
283 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.67 
 
 
313 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  26.02 
 
 
283 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.02 
 
 
283 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.93 
 
 
282 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.93 
 
 
282 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  25.93 
 
 
282 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  25.93 
 
 
282 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  25.93 
 
 
282 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.02 
 
 
283 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.78 
 
 
283 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.78 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  24.69 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.22 
 
 
416 aa  87.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.84 
 
 
273 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.75 
 
 
429 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.23 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  24.68 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.9 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.14 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.59 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  23.46 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.91 
 
 
274 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  24.62 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.12 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.87 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.69 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  22.39 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.85 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.85 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.26 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.25 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.46 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  26.45 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.81 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.39 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.91 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.4 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  30.17 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  24.2 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.81 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.14 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.56 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.95 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  28.76 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.69 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.78 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.55 
 
 
389 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  28.89 
 
 
376 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  24.78 
 
 
266 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.87 
 
 
281 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.01 
 
 
412 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.32 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  28.44 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.52 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.22 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  28.45 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  27.5 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.45 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>