47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3772 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3772  protein of unknown function DUF1121  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.602543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3856  protein of unknown function DUF1121  94.47 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4126  hypothetical protein  69.12 
 
 		 217 aa  323  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0125  hypothetical protein  65.44 
 
 		 217 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.776517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3334  hypothetical protein  64.52 
 
 		 217 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2935  protein of unknown function DUF1121  61.75 
 
 		 217 aa  297  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2921  protein of unknown function DUF1121  63.59 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.257573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1422  hypothetical protein  44.6 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0835369  normal  0.792436 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1212  hypothetical protein  43.66 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0486  hypothetical protein  44.13 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1410  hypothetical protein  45.75 
 
 		 213 aa  195  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.836587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0911  hypothetical protein  44.08 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.849271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1542  protein of unknown function DUF1121  41.78 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2335  hypothetical protein  42.45 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0478428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2612  hypothetical protein  38.65 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2929  hypothetical protein  38.65 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0236  hypothetical protein  39.8 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000188385  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2126  protein of unknown function DUF1121  38.97 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0025  protein of unknown function DUF1121  41.51 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0228107 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0773  hypothetical protein  38.07 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00386698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1094  hypothetical protein  38.5 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0796  hypothetical protein  38.07 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13570  Protein of unknown function (DUF1121)  34.3 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0598  protein of unknown function DUF1121  39.18 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21950  Protein of unknown function (DUF1121)  40.4 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0096  protein of unknown function DUF1121  36.18 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2470  protein of unknown function DUF1121  34.3 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0958  protein of unknown function DUF1121  38.94 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155501  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1905  hypothetical protein  35.27 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1208  hypothetical protein  36.92 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0762  hypothetical protein  34.25 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3273  hypothetical protein  35.12 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1893  protein of unknown function DUF1121  35.53 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1232  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1837  protein of unknown function DUF1121  37.07 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2993  protein of unknown function DUF1121  35.05 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.665625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2382  protein of unknown function DUF1121  37.08 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1305  protein of unknown function DUF1121  34.48 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1287  protein of unknown function DUF1121  36.32 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1793  protein of unknown function DUF1121  31.5 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0720312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0424  hypothetical protein  33.8 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0753  protein of unknown function DUF1121  35.03 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3138  protein of unknown function DUF1121  31.13 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2663  protein of unknown function DUF1121  27.33 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4815  hypothetical protein  32.93 
 
 		 209 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640334  normal  0.0869756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>