21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2823 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1389  hypothetical protein  96.69 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.724664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.763825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  29.86 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1973  hypothetical protein  29.59 
 
 		 271 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  26.8 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1421  hypothetical protein  29.49 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000974382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  27.19 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  26.58 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  30.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  27.34 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  31.63 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  22.52 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  26.38 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  24.44 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  25.64 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  24.82 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  25.83 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  26.5 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>