234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2410 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2410  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
326 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000136328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1808  fructose-1,6-bisphosphatase  98.47 
 
 
326 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00496308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2378  fructose-1,6-bisphosphatase  87.74 
 
 
313 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000114068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1651  fructose-1,6-bisphosphatase  83.44 
 
 
313 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1921  fructose-1,6-bisphosphatase  82.41 
 
 
314 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.114629  normal  0.367448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1964  fructose-1,6-bisphosphatase  77.88 
 
 
315 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1776  fructose-1,6-bisphosphatase  78.14 
 
 
323 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000288763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1027  fructose-1,6-bisphosphatase  67.1 
 
 
320 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.02959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0798  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.29 
 
 
298 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1610  fructose-bisphosphatase  41.39 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.617007  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1089  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  40 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1496  fructose-1,6-bisphosphatase  41.29 
 
 
349 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1680  fructose-1,6-bisphosphatase  40.56 
 
 
349 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1216  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  43.51 
 
 
345 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.696792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0430  fructose-1,6-bisphosphatase  41.42 
 
 
347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0441  fructose-1,6-bisphosphatase  41.42 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014948  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1328  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.97 
 
 
273 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3429  fructose-1,6-bisphosphatase  39.87 
 
 
349 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3912  fructose-1,6-bisphosphatase  43.06 
 
 
334 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.166278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0542  fructose-1,6-bisphosphatase  42.35 
 
 
334 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3714  fructose-1,6-bisphosphatase  42.7 
 
 
334 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.213043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0682  fructose-1,6-bisphosphatase  38.58 
 
 
354 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001689  fructose-1,6-bisphosphatase type I  40 
 
 
338 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0499  fructose-1,6-bisphosphatase  42.7 
 
 
334 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0464  fructose-1,6-bisphosphatase  42.7 
 
 
334 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000776402  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1674  fructose-1,6-bisphosphatase  40.12 
 
 
332 aa  202  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000201501  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3621  fructose-1,6-bisphosphatase  39.56 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3966  fructose-1,6-bisphosphatase  42.35 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3766  fructose-1,6-bisphosphatase  42.35 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00785  fructose-1,6-bisphosphatase  39.37 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1248  fructose-1,6-bisphosphatase  40.77 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0602  fructose-1,6-bisphosphatase  38.79 
 
 
333 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1796  fructose-1,6-bisphosphatase  39.09 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.88086  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2122  fructose-1,6-bisphosphatase  39.94 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4096  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  41.58 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0557  fructose-1,6-bisphosphatase  38.41 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2970  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  41.1 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1206  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  39.86 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  37.54 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0346  fructose-1,6-bisphosphatase  39.23 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.696166  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0461  fructose-1,6-bisphosphatase  38.11 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4835  fructose-1,6-bisphosphatase  41.58 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469676  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0023  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  36.84 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.210446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4780  fructose-1,6-bisphosphatase  41.58 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.507525  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4684  fructose-1,6-bisphosphatase  41.58 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4695  fructose-1,6-bisphosphatase  41.58 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4814  fructose-1,6-bisphosphatase  41.58 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  37.54 
 
 
336 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  37.28 
 
 
339 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0686  fructose-1,6-bisphosphatase  37.88 
 
 
332 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00984781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  37.74 
 
 
325 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  37.74 
 
 
342 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  37.74 
 
 
325 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  0.00000825139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  37.84 
 
 
336 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1063  fructose-1,6-bisphosphatase  36.3 
 
 
280 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0679702  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0857  fructose-1,6-bisphosphatase  40.59 
 
 
280 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.587337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  36.98 
 
 
339 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  37.09 
 
 
338 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  38.14 
 
 
336 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04100  fructose-1,6-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3762  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  38.14 
 
 
336 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  37.42 
 
 
330 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  37.91 
 
 
335 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04064  hypothetical protein  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4801  fructose-1,6-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4709  fructose-1,6-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4852  fructose-1,6-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4485  fructose-1,6-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3779  fructose-1,6-bisphosphatase  40.86 
 
 
332 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  37.04 
 
 
337 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  37.43 
 
 
336 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  37.46 
 
 
338 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0533  fructose-1,6-bisphosphatase  39.4 
 
 
334 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2335  fructose-1,6-bisphosphatase  38.85 
 
 
344 aa  192  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  37.11 
 
 
325 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  36.56 
 
 
339 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  38.02 
 
 
337 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02300  fructose-1,6-bisphosphatase  39.16 
 
 
339 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  37.61 
 
 
336 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  38.29 
 
 
336 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00470  fructose-bisphosphatase, putative  39.75 
 
 
350 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  37.65 
 
 
336 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0418  fructose-1,6-bisphosphatase  42.32 
 
 
332 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  38.02 
 
 
338 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5751  fructose-1,6-bisphosphatase  40.5 
 
 
332 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0927  fructose-1,6-bisphosphatase  39.21 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0859986  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0794  fructose-1,6-bisphosphatase  37.12 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000251337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  37.65 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  35.91 
 
 
338 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  37.42 
 
 
330 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000449089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  36.94 
 
 
335 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  40.57 
 
 
319 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000256898  unclonable  0.00000000000522982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  36.69 
 
 
364 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2986  fructose-1,6-bisphosphatase  38.05 
 
 
330 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  38.14 
 
 
329 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  36.61 
 
 
337 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  36.81 
 
 
338 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  36.79 
 
 
330 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000187487  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  35.65 
 
 
337 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>