28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0539 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000030974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0552  hypothetical protein  94.16 
 
 		 154 aa  275  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000878259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2921  hypothetical protein  55.26 
 
 		 154 aa  184  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000773857 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1997  hypothetical protein  45.27 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00184769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3341  hypothetical protein  38.16 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1332  hypothetical protein  38.3 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40870  hypothetical protein  33.77 
 
 		 168 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.317722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2383  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000028196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2202  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.666334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5218  hypothetical protein  34.42 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60570  hypothetical protein  34.42 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.672607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0710  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0679  hypothetical protein  33.12 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.80583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0711  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4260  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4506  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2011  hypothetical protein  37.89 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0048  hypothetical protein  46.9 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4586  hypothetical protein  33.12 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0063  hypothetical protein  42.34 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0047  hypothetical protein  42.34 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4870  hypothetical protein  31.17 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5247  hypothetical protein  32.59 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0051  hypothetical protein  41.44 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60960  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.775512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0758  hypothetical protein  31.71 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2798  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.822855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3812  hypothetical protein  23.94 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00440009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>