39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2555 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2555  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1619  transcriptional regulator MerR family  49.38 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  39.39 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 321 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 321 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  28.15 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  29.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  29.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  29.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  29.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  29.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  26.04 
 
 		 342 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 320 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 319 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>