186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2551 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  72.01 
 
 
470 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  100 
 
 
470 aa  931    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  40.73 
 
 
501 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2256  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.31 
 
 
512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  28.78 
 
 
574 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  25.42 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  27.31 
 
 
525 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  28.06 
 
 
507 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  27.07 
 
 
510 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  26.22 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  27.2 
 
 
515 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  25.81 
 
 
533 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  25.97 
 
 
533 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  25.8 
 
 
504 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  26.12 
 
 
533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  26.56 
 
 
526 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  25.88 
 
 
528 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  24.64 
 
 
518 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  25.26 
 
 
457 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  26.6 
 
 
524 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  25.87 
 
 
533 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.98 
 
 
459 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  27.03 
 
 
534 aa  150  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  25.43 
 
 
577 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  27.33 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  24.63 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  24.84 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  26.03 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  25.24 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  24.43 
 
 
522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  24.86 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.15 
 
 
557 aa  147  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  24.43 
 
 
522 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  25.53 
 
 
521 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.93 
 
 
567 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  24.22 
 
 
522 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  25 
 
 
571 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25 
 
 
571 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  25.64 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.29 
 
 
567 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.85 
 
 
556 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.34 
 
 
564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  25.16 
 
 
522 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  26.08 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  24.38 
 
 
570 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  25.98 
 
 
525 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  24.82 
 
 
522 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  23.99 
 
 
517 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  24.82 
 
 
522 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  24.58 
 
 
522 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  24.82 
 
 
522 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  26.07 
 
 
451 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  24.05 
 
 
569 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.26 
 
 
550 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  26.35 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  23.61 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  25.16 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  24.9 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  24.9 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  24.9 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.42 
 
 
560 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  24.9 
 
 
460 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  24.9 
 
 
460 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  25.1 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  25.51 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  25.15 
 
 
532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  28.14 
 
 
629 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  25.85 
 
 
513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  25.31 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  25.31 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  22.73 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  23.63 
 
 
520 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  25.51 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  24.58 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  25.31 
 
 
527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  26.46 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  25.78 
 
 
460 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  24.64 
 
 
526 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  24.81 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 
497 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.37 
 
 
594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  25.3 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  26.2 
 
 
476 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  24.52 
 
 
454 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  24.34 
 
 
460 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  27.42 
 
 
546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  24.7 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  22.06 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  23.7 
 
 
507 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  23.34 
 
 
779 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  23.97 
 
 
497 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  23.97 
 
 
497 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  24.26 
 
 
448 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  23.97 
 
 
497 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  24.21 
 
 
501 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  24.46 
 
 
501 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  24.7 
 
 
501 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  23.97 
 
 
497 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  24.67 
 
 
493 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  24.51 
 
 
508 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>