32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2527 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2527  Lysine efflux permease-like protein  100 
 
 
74 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1947  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75 
 
 
216 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0624164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1871  lysine exporter protein LysE/YggA  71.19 
 
 
200 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.13 
 
 
206 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2067  lysE/yggA family protein  68.33 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0288158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1848  lysE/yggA family protein  68.33 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1820  amino acid transporter LysE  68.33 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1803  amino acid transporter LysE  68.33 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1989  lysE/yggA family protein  68.33 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2024  lysE/yggA family protein  68.33 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.37394e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3338  lysE/yggA family protein  68.33 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.604922  hitchhiker  0.0000000000000142617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2086  lysE/yggA family protein  68.33 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000150572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1852  lysine exporter protein LysE/YggA  68.33 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1991  lysE/yggA family protein  66.67 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0902  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60 
 
 
209 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0825  lysine exporter protein LysE/YggA  59.68 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.581148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0842  lysine exporter protein LysE/YggA  59.68 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.491756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  41.54 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  41.54 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  41.54 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  38.33 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  38.33 
 
 
199 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26510  Lysine exporter protein  38.81 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  36.67 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  45 
 
 
208 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 
209 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  36.51 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  40 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  42.37 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>