122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1666 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1666  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4119  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.9 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.73 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  56.36 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.85 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0563  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.57 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.978670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.44 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3953  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.64 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616189  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.59 
 
 
373 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
431 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.66 
 
 
636 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  42.62 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  44.64 
 
 
345 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  43.33 
 
 
70 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  38.18 
 
 
273 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.05 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.132482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 
298 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  31.88 
 
 
435 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2243  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.14 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000430291  normal  0.0350481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0237  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.84 
 
 
432 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  39.34 
 
 
510 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0267  putative pyruvate formate lyase activating enzyme  41.3 
 
 
298 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
589 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 
298 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  32.14 
 
 
443 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  45.1 
 
 
315 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  44.68 
 
 
292 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  34.43 
 
 
443 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3247  iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 
243 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2408  radical activating enzyme  39.22 
 
 
286 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.82 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.31 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  37.74 
 
 
636 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  40.68 
 
 
318 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  34.48 
 
 
386 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1702  ferredoxin  39.66 
 
 
240 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.06 
 
 
635 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.9 
 
 
293 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  31.08 
 
 
272 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0270  radical SAM domain-containing protein  44.68 
 
 
292 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  35.59 
 
 
410 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1834  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.86 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162171  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  43.86 
 
 
505 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2065  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.86 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.638489  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.78 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0716238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.64 
 
 
301 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2376  putative ferredoxin protein  44.83 
 
 
719 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847567  hitchhiker  0.00764754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  34.48 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  35.59 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  41.07 
 
 
597 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  45.61 
 
 
502 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
443 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  40.35 
 
 
503 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  37.74 
 
 
644 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.89 
 
 
421 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
269 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4316  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.689523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 
370 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  33.9 
 
 
439 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.29 
 
 
277 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232825  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3448  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 
250 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  35.59 
 
 
410 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  46.15 
 
 
176 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  40.35 
 
 
598 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  40.74 
 
 
291 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  38.24 
 
 
478 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 
242 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
503 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  41.38 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 
250 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.62 
 
 
435 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.93 
 
 
597 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3185  Iron-sulfur cluster-binding protein  35.59 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000998162 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  37.29 
 
 
313 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
389 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 
377 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
283 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  38.18 
 
 
275 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  34.55 
 
 
318 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 
1116 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.61 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  40.35 
 
 
510 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  40.35 
 
 
510 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  34.29 
 
 
484 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.07 
 
 
282 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 
271 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  38.33 
 
 
1150 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
498 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>