18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1548 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1548  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  29.79 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  22.45 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  22.45 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  26.62 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  27.59 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  27.86 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  24.26 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  26.43 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  27.07 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  27.07 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  24.09 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  23.49 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  22.14 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  29.79 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  21.28 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>