More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1471 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1471  HD domain-containing protein  100 
 
 		 391 aa  795    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1365  metal dependent phosphohydrolase  68.05 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335417  hitchhiker  0.0000000149519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2188  metal dependent phosphohydrolase  61.95 
 
 		 395 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2895  metal dependent phosphohydrolase  56.78 
 
 		 416 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1330  metal dependent phosphohydrolase  56.78 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000034965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1470  metal dependent phosphohydrolase  51.97 
 
 		 257 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1002  metal dependent phosphohydrolase  42.75 
 
 		 560 aa  199  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1136  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.73 
 
 		 348 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4270  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.73 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1204  metal dependent phosphohydrolase  46.32 
 
 		 553 aa  186  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.42 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 357 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3046  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.19 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0429754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0913  hypothetical protein  45.07 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.512089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  48.91 
 
 		 572 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  47.12 
 
 		 574 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.4 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.48 
 
 		 353 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 		 685 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  45.03 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 		 691 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  44.55 
 
 		 558 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  44.06 
 
 		 565 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.09 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.88 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1882  metal dependent phosphohydrolase  43 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.898808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1467  HD domain-containing protein  44.55 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2231  putative metal dependent phosphohydrolase  38.91 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.54 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0059  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 717 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.85 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.85 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.29 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.3 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0097  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 		 319 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  43.81 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1387  HD domain-containing protein  42.51 
 
 		 422 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1420  putative PAS/PAC sensor protein  41.71 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.108233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0081  two component transcriptional regulator, AraC family  47.34 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  45.03 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1744  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.19 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  43.13 
 
 		 269 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2833  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  41.84 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2300  metal dependent phosphohydrolase  41.06 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  42.27 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  43.72 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.23 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0963  response regulator  41.63 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3086  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.688804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1421  putative PAS/PAC sensor protein  38.3 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0232449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1281  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.246487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.26 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3096  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  40.5 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.75 
 
 		 328 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3239  metal dependent phosphohydrolase  41.06 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  41.51 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  43.3 
 
 		 340 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 350 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.63 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.87 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1019  putative response regulator  38.86 
 
 		 522 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2330  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541081  normal  0.158055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  44.44 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2484  metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 		 723 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2945  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.92 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  43.56 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  42.21 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  51.66 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 		 654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  40.1 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>