237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0479 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0479  Rhomboid family protein  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000451425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0462  Rhomboid family protein  95.38 
 
 		 238 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1637  rhomboid family protein  62.3 
 
 		 277 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  50.98 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2186  rhomboid family protein  56.97 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2385  rhomboid-like protein  56.67 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1188  rhomboid family protein  58.89 
 
 		 181 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0257893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  36.87 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  38.16 
 
 		 386 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  33.68 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  38.41 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.21 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.16 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.6 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.5 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.57 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.5 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  35.95 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 511 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  38.36 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.03 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  36.43 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  35.06 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  31.71 
 
 		 569 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  33.52 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30.99 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  26.64 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  28.9 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.12 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  32.1 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  37.06 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  30.04 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  28.92 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  31.2 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  32.08 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  30.16 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  32.82 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  32.03 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  34.67 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  31.14 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  32.86 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  28.5 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  31.41 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  27.98 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  31.41 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  31.41 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  29.89 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  27.74 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  31.34 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.05 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  31.43 
 
 		 570 aa  58.9  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.35 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.69 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  30 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  34.65 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  31.85 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  29.02 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30.82 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  30.12 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  31.28 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  31.29 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  29.73 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  27.86 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  30.34 
 
 		 375 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  26.04 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  29.63 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 523 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  29.87 
 
 		 625 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.75 
 
 		 579 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 625 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  36.89 
 
 		 528 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  29.28 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.32 
 
 		 625 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.65 
 
 		 554 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  30.57 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  30.32 
 
 		 625 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  30.59 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  26.04 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  36.67 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  34.23 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  31.49 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  29.25 
 
 		 541 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>