9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0012 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0538818  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0052  tRNA-Leu  98.68 
 
 		 78 bp  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>