12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5725 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5725  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1033    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0492  hypothetical protein  29.81 
 
 
403 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00346684  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7956  hypothetical protein  34.38 
 
 
358 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0599296  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0514  hypothetical protein  25.78 
 
 
454 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591074  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2652  hypothetical protein  31.88 
 
 
226 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.909396  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  34.59 
 
 
633 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1510  hypothetical protein  39.41 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2651  hypothetical protein  33.16 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468315  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  30.77 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0190  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  31.45 
 
 
731 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4259  hypothetical protein  31.4 
 
 
847 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178114  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1512  hypothetical protein  26.01 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>