More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5616 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5616  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 347 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0605675  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0925  LuxR family transcriptional regulator  80.14 
 
 		 297 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4027  LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  35.46 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1067  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.506731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.12 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  33.76 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2151  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  50.88 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.85 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00793239  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 258 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.56 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  45.57 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02135  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0640  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3086  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.77 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1682  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  39.68 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  40.32 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  52 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  39.68 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05474  transcription regulator protein  40.58 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4836  DNA binding response regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  47.06 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.68 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  42.03 
 
 		 917 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.74 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  49.28 
 
 		 776 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 204 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 916 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.19 
 
 		 911 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  34.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4376  LuxR response regulator receiver  49.18 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 208 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 218 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 226 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4339  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 218 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 214 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 222 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 213 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0619  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 258 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  40.3 
 
 		 91 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  40.3 
 
 		 90 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  37.5 
 
 		 92 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  35.2 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 970 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 92 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>