14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3979 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3979  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3240  transposase IS116/IS110/IS902  75 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4216  transposase IS116/IS110/IS902  75 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1016  transposase IS116/IS110/IS902  84.21 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8544  transposase IS111A/IS1328/IS1533  73.68 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328773  hitchhiker  0.0000433231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7122  transposase IS111A/IS1328/IS1533  68.42 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4175  hypothetical protein  71.05 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8250  hypothetical protein  71.05 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0254925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4692  hypothetical protein  65.79 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.661075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2998  transposase IS111A/IS1328/IS1533  54.69 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1666  transposase IS116/IS110/IS902  68.42 
 
 		 100 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0424632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.24 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.24 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1197  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  58.14 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>