25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3832 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3832    100 
 
 
455 bp  902    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0202078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  88.52 
 
 
951 bp  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  86.96 
 
 
1068 bp  363  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  86.7 
 
 
1068 bp  355  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  85.9 
 
 
1068 bp  329  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  84.91 
 
 
1068 bp  299  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  84.91 
 
 
900 bp  299  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  85.83 
 
 
1080 bp  293  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  84.64 
 
 
1068 bp  276  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  86.49 
 
 
1002 bp  262  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  86.21 
 
 
597 bp  218  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0524    83.29 
 
 
952 bp  218  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6346    83.92 
 
 
523 bp  204  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  90.14 
 
 
402 bp  170  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  87.15 
 
 
711 bp  165  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  96.43 
 
 
549 bp  143  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  83.18 
 
 
708 bp  127  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  85.28 
 
 
912 bp  125  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  83.07 
 
 
486 bp  121  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0492    86.36 
 
 
324 bp  99.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  91.94 
 
 
1029 bp  83.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  100 
 
 
759 bp  63.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  92.5 
 
 
558 bp  56  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  89.36 
 
 
444 bp  54  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  93.02 
 
 
165 bp  54  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>