More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3556 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3556  ABC transporter related  100 
 
 		 549 aa  1036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.15 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  37.16 
 
 		 613 aa  294  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  39.01 
 
 		 546 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  38.49 
 
 		 550 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  41.88 
 
 		 566 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  37.5 
 
 		 543 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  36.21 
 
 		 613 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.49 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  35.59 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 594 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.5 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  34.42 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 593 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  35.78 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.4 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  36.28 
 
 		 531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  38.52 
 
 		 624 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 544 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  39.51 
 
 		 621 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  39.16 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  37.17 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  36.12 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  38.33 
 
 		 624 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 601 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  35.51 
 
 		 557 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.63 
 
 		 534 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  37.95 
 
 		 608 aa  264  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  38.33 
 
 		 624 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  37.1 
 
 		 603 aa  263  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  37.06 
 
 		 585 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5586  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.88 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249808  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  35.55 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  36.5 
 
 		 547 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 		 545 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 614 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  33.77 
 
 		 561 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  33.77 
 
 		 565 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  38.34 
 
 		 557 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  36.56 
 
 		 544 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 614 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  36.03 
 
 		 531 aa  259  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  36.54 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00740  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.74 
 
 		 578 aa  259  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  34.36 
 
 		 527 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.38 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  36.67 
 
 		 569 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  37.4 
 
 		 569 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  35.51 
 
 		 551 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 		 611 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  35.51 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  36.12 
 
 		 544 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  37.04 
 
 		 553 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.42 
 
 		 568 aa  257  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  36.35 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 620 aa  257  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  34.13 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  31.93 
 
 		 543 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.03 
 
 		 525 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.91 
 
 		 531 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  35.59 
 
 		 545 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  34.96 
 
 		 542 aa  256  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  37.07 
 
 		 575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  34.22 
 
 		 545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  35.29 
 
 		 537 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  33.84 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  36.65 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  33.9 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  35.54 
 
 		 533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  33.15 
 
 		 555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  34.19 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  32.95 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2108  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 600 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 867 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  34.54 
 
 		 539 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.41 
 
 		 669 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.219449  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  34.71 
 
 		 557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  32.95 
 
 		 566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  34.21 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  36.76 
 
 		 550 aa  253  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.62 
 
 		 572 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  34.98 
 
 		 545 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  36.06 
 
 		 556 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  37.85 
 
 		 538 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  36.96 
 
 		 659 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  35.41 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  38.11 
 
 		 540 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.71 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  32.9 
 
 		 527 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  34.03 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  35.33 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  34.52 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  32.3 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>