23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2527 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2527    100 
 
 
231 bp  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  91.44 
 
 
951 bp  289  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  90.48 
 
 
549 bp  283  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  90.13 
 
 
1068 bp  268  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  89.61 
 
 
912 bp  268  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  90.09 
 
 
1068 bp  266  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  89.43 
 
 
708 bp  260  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  89.35 
 
 
1002 bp  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  88.31 
 
 
1080 bp  244  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  88.24 
 
 
900 bp  232  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  87.45 
 
 
1068 bp  228  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  87.22 
 
 
558 bp  220  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  86.15 
 
 
1068 bp  204  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  87.13 
 
 
711 bp  194  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  85.39 
 
 
1068 bp  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  89.26 
 
 
246 bp  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0524    83.41 
 
 
952 bp  149  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  90.08 
 
 
198 bp  145  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  89.26 
 
 
198 bp  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  92 
 
 
444 bp  135  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  81.72 
 
 
1029 bp  99.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2522    91.07 
 
 
225 bp  71.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  80.82 
 
 
297 bp  67.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>