199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2362 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2362  short chain oxidoreductase  100 
 
 
128 aa  262  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.59 
 
 
256 aa  222  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.57 
 
 
264 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
261 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.48 
 
 
264 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.52 
 
 
264 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.52 
 
 
264 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
276 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364215  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 
270 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.6 
 
 
265 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0163274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
270 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.442455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
270 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0110329  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 
271 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320564  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
263 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
262 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
262 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
262 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
258 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
259 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
269 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
260 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
261 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
265 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.08 
 
 
259 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
263 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
259 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
277 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
263 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
291 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
264 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
261 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
300 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
282 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
265 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
277 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
267 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
260 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
268 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
258 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  33.62 
 
 
275 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
256 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05861  3-ketoacyl-CoA reductase (3-ketoreductase)(KAR)(EC 1.1.1.-)(Microsomal beta-keto-reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0R9]  41.18 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0426828  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
276 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.9 
 
 
257 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
286 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
259 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.04 
 
 
257 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
271 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
261 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
264 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
261 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
263 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
267 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
271 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
256 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
294 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
250 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
268 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
268 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
268 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 
260 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
255 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
264 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
259 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.81 
 
 
259 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6102  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
264 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0605001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
256 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
276 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
268 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
262 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
289 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
260 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
268 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522448  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 
259 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
258 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
252 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
257 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79198  beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 3  38.46 
 
 
346 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
251 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
259 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
275 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  44.83 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
271 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.04 
 
 
260 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
340 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
259 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
340 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
266 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
260 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
261 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
255 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
267 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
275 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>