47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1712 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  100 
 
 		 106 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  93.2 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  67.65 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  67.65 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  70.87 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  72.82 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1359  hypothetical protein  70.87 
 
 		 107 aa  121  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  0.0604733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  70.75 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  63.11 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  58.82 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  56.31 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  59 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  62.75 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5239  hypothetical protein  72.55 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5346  hypothetical protein  64.08 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  53.4 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15610  hypothetical protein  71.57 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.167288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1849  hypothetical protein  62.14 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317329  normal  0.137078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3128  hypothetical protein  69.9 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  67.65 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  67.31 
 
 		 190 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  66.35 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  67.65 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  67.65 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  62.75 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  67.65 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  67.65 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  67.65 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2993  hypothetical protein  64.08 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.65036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  66.67 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18020  hypothetical protein  59.41 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00327498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14790  hypothetical protein  55.14 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2041  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00591086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1714  hypothetical protein  59.49 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0927785  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  53.4 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  63.11 
 
 		 104 aa  91.3  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  54 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  49 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12710  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0463914  normal  0.0241518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  53 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  46 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  51.52 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1997  putative integration host factor IHF  51 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3207  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12560  hypothetical protein  43.37 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1474  hypothetical protein  33.98 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0390254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>