68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1669 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1669  putative thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 176 aa  347  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4819  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.49 
 
 		 322 aa  140  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2451  hypothetical protein  55.49 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3403  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.37 
 
 		 339 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3651  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.15 
 
 		 339 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1565  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  49.35 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5357  FAD dependent oxidoreductase  51.48 
 
 		 343 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4820  hypothetical protein  46.63 
 
 		 282 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1966  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.54 
 
 		 340 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5295  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.47 
 
 		 323 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2591  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.31 
 
 		 381 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3433  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.92 
 
 		 321 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0694446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7926  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 		 331 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.949159  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1718  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 317 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.13542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.47 
 
 		 342 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03360  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 350 aa  104  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3020  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.21 
 
 		 319 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0634  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.05 
 
 		 324 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0508  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.77 
 
 		 315 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.62 
 
 		 335 aa  94.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169435  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0798  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.64 
 
 		 324 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.98 
 
 		 318 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.24 
 
 		 311 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.11 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2428  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4153  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.18 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4049  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.027558  normal  0.960138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 		 302 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8118  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.36 
 
 		 338 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.14 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.518178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3154  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.89 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04260  thioredoxin reductase  32.52 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0975  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.72 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000415137  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1396  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.28 
 
 		 301 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3434  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.81 
 
 		 302 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0828133  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.22 
 
 		 322 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.58 
 
 		 312 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3351  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.58 
 
 		 312 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3340  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.58 
 
 		 312 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.380513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2581  thioredoxin reductase  25.81 
 
 		 303 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2768  thioredoxin reductase  25.81 
 
 		 301 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.947222  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.68 
 
 		 301 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0405079  normal  0.116045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3571  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.48 
 
 		 304 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0817601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3486  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.48 
 
 		 304 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5305  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.14 
 
 		 304 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5574  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5193  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 		 311 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.963951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5282  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0929  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.57 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2537  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000508912  normal  0.479431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3949  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.7 
 
 		 297 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0182285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 		 337 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1307  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.45 
 
 		 340 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0014  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.25 
 
 		 300 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.783797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4049  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.59 
 
 		 309 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3616  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 304 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0012  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.93 
 
 		 299 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1477  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  33.33 
 
 		 303 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.441944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2255  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.92 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2894  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0013  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.08 
 
 		 300 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 		 307 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0015  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 300 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2548  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 304 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>