More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0836 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0836  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 220 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00741803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2162  DNA repair protein RadC  54.38 
 
 		 218 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1077  DNA repair protein RadC  58.53 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  31.31 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  30.84 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  37.1 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  36.32 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  34.43 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  35.32 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  30.73 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  31.9 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  33.76 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  29.11 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  34.42 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  38.21 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  34.96 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  32.55 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  37.04 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  39.41 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  33.8 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  30.56 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  31.8 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  33.97 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  32.56 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  32.08 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  27.52 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  30.66 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  34.58 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  34.33 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  32.86 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  34.1 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  36.11 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  34.43 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  35.82 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  35.82 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  35.82 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  34.33 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1834  DNA repair protein RadC  31.9 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2119  DNA repair protein RadC  31.43 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  32.55 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  28.97 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  35.32 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>