26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0492 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0492    100 
 
 
324 bp  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  91.64 
 
 
402 bp  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  91.64 
 
 
1068 bp  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  91.02 
 
 
1068 bp  410  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  89.78 
 
 
1068 bp  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  89.47 
 
 
1068 bp  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  87.89 
 
 
486 bp  329  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  86.69 
 
 
1080 bp  299  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  85.71 
 
 
1068 bp  274  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  84.57 
 
 
1029 bp  250  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6346    84.88 
 
 
523 bp  246  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  92.13 
 
 
1002 bp  242  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  92.67 
 
 
156 bp  210  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  87.44 
 
 
951 bp  196  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  90.62 
 
 
165 bp  190  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  90.6 
 
 
912 bp  184  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  85.63 
 
 
1239 bp  147  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  91.59 
 
 
900 bp  141  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0524    81.99 
 
 
952 bp  139  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  89.09 
 
 
213 bp  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3832    86.36 
 
 
455 bp  99.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0202078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  92 
 
 
207 bp  67.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4365  hypothetical protein  85.51 
 
 
207 bp  58  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  96.97 
 
 
597 bp  58  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1465  hypothetical protein  85.51 
 
 
207 bp  58  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2522    91.89 
 
 
225 bp  50.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>