17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0117 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0117  peptidase C2 calpain  100 
 
 
598 aa  1157    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4450  peptidase C2, calpain  44.09 
 
 
279 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  32.18 
 
 
360 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  29.49 
 
 
384 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  32.62 
 
 
361 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45234  predicted protein  34.98 
 
 
935 aa  73.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19510  Calpain family cysteine protease  34.64 
 
 
258 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5424  hypothetical protein  27.83 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328963 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16523  predicted protein  27.39 
 
 
823 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03130  hypothetical protein  33.94 
 
 
277 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27173  predicted protein  34.15 
 
 
474 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.295693 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29736  predicted protein  34.15 
 
 
474 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.692446  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0619  hypothetical protein  26.85 
 
 
393 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  27.62 
 
 
827 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10513  calpain-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07970)  25.85 
 
 
834 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  26.58 
 
 
3754 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.38288 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00256  Calpain-like protease palB (EC 3.4.22.-)(Cysteine protease palB) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00204]  24.17 
 
 
847 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0894791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>