14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4450 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4450  peptidase C2, calpain  100 
 
 		 279 aa  547  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0117  peptidase C2 calpain  44.09 
 
 		 598 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  29.91 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  30.19 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  25.9 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45234  predicted protein  32.55 
 
 		 935 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5424  hypothetical protein  25.17 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328963 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00256  Calpain-like protease palB (EC 3.4.22.-)(Cysteine protease palB) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00204]  35.29 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03130  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  27.85 
 
 		 3754 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10513  calpain-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07970)  26.16 
 
 		 834 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27173  predicted protein  23.19 
 
 		 474 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.295693 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29736  predicted protein  23.19 
 
 		 474 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.692446  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56126  predicted protein  25.71 
 
 		 744 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.937761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>