89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3860 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3860  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  630  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493821  normal  0.355777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0869  putative transcritional regulator  58.88 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  32.26 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  31.38 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  35.9 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  31.25 
 
 		 271 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  38.64 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  30.48 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  43.17 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  29.79 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  29.79 
 
 		 265 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  35.2 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  35.94 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  36.16 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0499  hypothetical protein  37.4 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.623817  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  37.27 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43473  predicted protein  35.71 
 
 		 437 aa  85.9  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  29.68 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  34.9 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  34.9 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  34.9 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  37.27 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2554  hypothetical protein  37.11 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11238  normal  0.887248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  24.11 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  36.59 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  33.86 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  35.75 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  32.67 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  34.52 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  33.93 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  34.52 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  32.4 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  34.52 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  34.52 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  34.52 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  37.16 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  32.18 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  34.44 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  35.56 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6509  predicted protein  31.94 
 
 		 216 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236184  normal  0.418162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  33.18 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  32.18 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  32.73 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  35.83 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0087  hypothetical protein  36.54 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.255574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  46.05 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  27.36 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2055  hypothetical protein  28.07 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4618  hypothetical protein  28.92 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4478  hypothetical protein  28.92 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  28.33 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  29.05 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1707  hypothetical protein  37.8 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  28.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  28.33 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  28.33 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3588  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3249  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4602  hypothetical protein  36.92 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19860  hypothetical protein  36.67 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2893  hypothetical protein  25.86 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0753  hypothetical protein  26.21 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5838  hypothetical protein  27.59 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  23.33 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1164  hypothetical protein  40.54 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10750  hypothetical protein  36.5 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0284  hypothetical protein  24.19 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  0.168748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0820  hypothetical protein  36.43 
 
 		 268 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0176  hypothetical protein  29 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.244166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2563  hypothetical protein  27.43 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.610667  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1473  hypothetical protein  24.44 
 
 		 218 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.797183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1191  hypothetical protein  32.56 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  22.84 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  24.37 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  23.67 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3542  hypothetical protein  28.49 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000309634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3733  hypothetical protein  28.49 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0701  hypothetical protein  28.49 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3610  hypothetical protein  28.49 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0588613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0923  hypothetical protein  29.89 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00500148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  33.9 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 269 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>