246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3383 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3383  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.295645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.89 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.89 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50.89 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  50 
 
 
122 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.68 
 
 
144 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.35 
 
 
129 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.52 
 
 
129 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  44.54 
 
 
139 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  45.61 
 
 
129 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.13 
 
 
139 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 
143 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.22 
 
 
129 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.61 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.37 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.45 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.61 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1644  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.49 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.05 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.32 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.32 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  47.12 
 
 
118 aa  95.9  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.5 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000420055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000199367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.8 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.62 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2205  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.87 
 
 
129 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.709249  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0471  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.51 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.84 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.84 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0991  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  42.73 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.780472  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1886  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.22 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4416  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.59 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04701  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.09 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1832  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.86 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.220331  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.87 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.72 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16401  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.32 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0442  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.67 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1463  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.23 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1828  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.28 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1759  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.36 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.43 
 
 
154 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2198  GTP cyclohydrolase I  46.08 
 
 
134 aa  87  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1742  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.48 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2098  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.35 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.819295  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.18 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2482  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.4 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.245028  normal  0.291037 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15801  GTP cyclohydrolase I-like protein  39.78 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3061  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.5 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149415 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1140  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.36 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.972823  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0230  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.71 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0561  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.34 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.5 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16511  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.18 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5893  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.34 
 
 
150 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.35 
 
 
154 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0685  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.76 
 
 
116 aa  84  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.34 
 
 
159 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0514  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.12 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16631  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.18 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0579  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.06 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.84 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3110  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.58 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1554  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.18 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.26 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.83 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0000104861  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3009  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.58 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.34 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.4 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1627  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.06 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3217  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.81 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.74 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.56 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.34 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2779  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.16 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2817  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.16 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153581  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.37 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.37 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2044  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.82 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1060  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.74 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.356271  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3756  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.5 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.34 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0608  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.69 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.18 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>