36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2643 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2643  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  100 
 
 		 259 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.654173  normal  0.264962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4893  hypothetical protein  77.22 
 
 		 259 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379402  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1934  hypothetical protein  58.43 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.019437  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5932  hypothetical protein  59.51 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0174628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2285  hypothetical protein  56.15 
 
 		 265 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2758  hypothetical protein  55.37 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2167  hypothetical protein  54.86 
 
 		 279 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0665793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2665  hypothetical protein  54.04 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1171  hypothetical protein  56.58 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2321  hypothetical protein  52.14 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19810  Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  50.19 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1835  hypothetical protein  53.62 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.15794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2778  hypothetical protein  49.43 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000110826  hitchhiker  0.0000594492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3451  hypothetical protein  48.84 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00447227  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26360  Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  50.78 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2103  hypothetical protein  48.03 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000498307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16030  hypothetical protein  47.64 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2441  hypothetical protein  46.1 
 
 		 281 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3167  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  44.44 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3155  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  44.06 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0715316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1953  hypothetical protein  47.2 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3217  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  44.06 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5401  hypothetical protein  45.62 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3046  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  45.25 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.889585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2627  hypothetical protein  47.04 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12163  hypothetical protein  42.59 
 
 		 262 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.822562  normal  0.390759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3480  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  43.66 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.244683  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0110  hypothetical protein  46.22 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2139  hypothetical protein  44.57 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4254  hypothetical protein  46.44 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0006  hypothetical protein  46.35 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1835  hypothetical protein  48.51 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.675451  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3402  hypothetical protein  41.91 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1692  hypothetical protein  44 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0994  hypothetical protein  35.32 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0258  hypothetical protein  36.93 
 
 		 240 aa  116  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>