More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2255 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2255  ABC transporter related  100 
 
 		 447 aa  870    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00103135  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1898  ABC transporter related  63.57 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.44 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  41.18 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  37.56 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  39.12 
 
 		 384 aa  257  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  39.22 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.6 
 
 		 359 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  39.66 
 
 		 360 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 360 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  49.46 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  39.61 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  41.09 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  41.09 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  46.15 
 
 		 352 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  39.56 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 371 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  45.45 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  49.42 
 
 		 366 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  52.71 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.52 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  40.84 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  36.34 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  44.01 
 
 		 370 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  47.6 
 
 		 363 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  47.6 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  42 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  49.04 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  39.42 
 
 		 365 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  45.54 
 
 		 379 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1391  ABC transporter related  36.01 
 
 		 362 aa  249  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00218613  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  43.93 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  39.12 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  45.32 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.84 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  39.12 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  43.24 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.8 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 		 332 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  45.27 
 
 		 360 aa  247  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  39.33 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.86 
 
 		 356 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  37.96 
 
 		 340 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.86 
 
 		 356 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  37.59 
 
 		 370 aa  246  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  41.22 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  47.94 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  41.22 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  38.6 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  38.65 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  37.68 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  41.74 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.19 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  42.37 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  43.48 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  48 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  49.79 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.19 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  47.89 
 
 		 332 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.22 
 
 		 356 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 374 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  41.12 
 
 		 367 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  36.96 
 
 		 372 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  47.57 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  41.12 
 
 		 367 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  39.23 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  49.79 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  35.92 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  49.22 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  43.32 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  41.33 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  39.16 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  51.9 
 
 		 361 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.41 
 
 		 362 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.38 
 
 		 361 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  44.69 
 
 		 351 aa  243  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  43.69 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 333 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  44.75 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 406 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>