21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2231 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2231  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2531  hypothetical protein  76.84 
 
 
192 aa  304  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2659  hypothetical protein  57.14 
 
 
189 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.85138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1862  hypothetical protein  55.03 
 
 
189 aa  214  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1283  hypothetical protein  58.2 
 
 
182 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.841375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0953  hypothetical protein  54.69 
 
 
191 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.283829  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0955  hypothetical protein  49.25 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1009  hypothetical protein  52.08 
 
 
206 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2035  hypothetical protein  49.74 
 
 
191 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215507  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1353  hypothetical protein  46.81 
 
 
201 aa  174  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3150  hypothetical protein  46.35 
 
 
192 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.400188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1256  hypothetical protein  33.16 
 
 
190 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0851  hypothetical protein  34.9 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.315741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0715  hypothetical protein  35.6 
 
 
190 aa  124  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494717  normal  0.0492268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1784  hypothetical protein  34.55 
 
 
190 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362229  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2839  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  117  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0337926  normal  0.345885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1296  hypothetical protein  31.18 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1841  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  94.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00444327  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0006  hypothetical protein  30.85 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.901562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0208  hypothetical protein  29.31 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1188  hypothetical protein  33.51 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>