95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1828 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1828  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.896202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2625  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  88.66 
 
 		 99 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1815  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.89 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1826  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.63 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2839  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.89 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.56 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.48 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.68 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.7 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.7 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.7 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1071  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.83 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0179727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0453  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9123  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.59 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.63 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.35 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.09 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.67 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4439  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.91 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4254  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.91 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.851257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4440  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase, putative  31.91 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4092  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase)  31.91 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4587  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.91 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1942  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.16 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.89 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4103  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase)  31.91 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4490  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.91 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  26.88 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0712  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.18 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.91 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3077  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.22 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.231945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1438  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000681938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.79 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4478  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.85 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0758  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.85 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.78 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.22 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  22.92 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5415  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.22 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.236997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4174  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  30.53 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04911  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  24.73 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.449188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.96 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4206  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.79 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.67 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2817  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.52 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0492  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.03 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.032217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0741  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.43 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.87 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1824  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  21.88 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.749262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  35.53 
 
 		 232 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.84 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.83 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.84 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.84 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5972  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0257704  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  32.73 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0248  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.65 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1218  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.77 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0727  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.59 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.856744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.53 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000224149  normal  0.214474 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1536  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.38 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.37 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2045  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.33 
 
 		 107 aa  42  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0827962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.18 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.52 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0254  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.05 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.569153 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  24.44 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  26.97 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.93 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0994809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1481  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.59 
 
 		 115 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3519  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.85 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.777034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.71 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.7 
 
 		 224 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.18 
 
 		 94 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3734  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  26.09 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4055  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.65 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579809  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0745  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.26 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.78 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1611  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.871945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11184  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.26 
 
 		 94 aa  40  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000707636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  21.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1841  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  25.77 
 
 		 95 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4024  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.89 
 
 		 117 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>