166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1762 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1762  rubrerythrin  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  45.31 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  44.19 
 
 		 140 aa  116  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  42.97 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  43.31 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  43.31 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  42.52 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  42.52 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  42.52 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  39.04 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  43.31 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.64 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  41.73 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  41.73 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  39.73 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  44.09 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  41.73 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  42.52 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.22 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  43.31 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  44 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  40.94 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.16 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  40.48 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  40.48 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  39.68 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  38.93 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  36.64 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  38.4 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  36.13 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  28.99 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  34.65 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  34.65 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  33.61 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  35.07 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  39.8 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  36.29 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  35.94 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  39.62 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  34.33 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  31.82 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  29.2 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  33.59 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  32.56 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  33.86 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  33.86 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  35.48 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  34.38 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  30.53 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  32.28 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  31.16 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  32.28 
 
 		 392 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  33.59 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  31.3 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  26.06 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  33.6 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  33.08 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  27.34 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  33.33 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  26.62 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  29.85 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  35.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  27.13 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  29.13 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  34.27 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  29.46 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  29.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  31.06 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  28.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  30.53 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  27.34 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  34.81 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  31.5 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  30.3 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  27.91 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  31.06 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  29.92 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  29.01 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  31.75 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  37.5 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  26.95 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  34.31 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  31.75 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  50.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  32.28 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  28.24 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  30.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  29.6 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  32.28 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  29.84 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  27.42 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  38.14 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>