12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0416 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0416  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  80.7 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  72.73 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  72.73 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  72.73 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  72.73 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  72.73 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6778  hypothetical protein  66.67 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  55.1 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  48.98 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>