15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0039 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 813 aa  1522    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7293  hypothetical protein  55.4 
 
 		 1095 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  26.13 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.6 
 
 		 3409 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.34 
 
 		 698 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  25.58 
 
 		 619 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  24.52 
 
 		 899 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.34 
 
 		 2449 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 		 495 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  26.18 
 
 		 639 aa  51.6  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  26.84 
 
 		 926 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 		 665 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 		 1132 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  26.91 
 
 		 968 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1519 aa  45.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>