More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1785 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1785  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
586 aa  1182    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1726  peptidoglycan glycosyltransferase  42.37 
 
 
574 aa  405  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.413721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 
582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 
582 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0867  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 
563 aa  206  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.852726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 
680 aa  180  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.02 
 
 
708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  27.85 
 
 
719 aa  173  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.92 
 
 
711 aa  169  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  26.89 
 
 
660 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.62 
 
 
657 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 
654 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
670 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.24 
 
 
675 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.96 
 
 
644 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  26.6 
 
 
657 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  25.9 
 
 
657 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 
672 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 
653 aa  163  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
657 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
727 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.62 
 
 
695 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 
705 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.94 
 
 
645 aa  156  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
656 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.21 
 
 
582 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
556 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
586 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 
704 aa  153  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.91 
 
 
662 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0550  penicillin-binding protein  27.39 
 
 
602 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.91 
 
 
607 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
680 aa  150  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0629  penicillin-binding protein  28.14 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.57 
 
 
716 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.36 
 
 
703 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 
677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.59 
 
 
754 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1406  penicillin-binding protein  27.12 
 
 
602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.098253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  29.36 
 
 
740 aa  148  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 
684 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.55 
 
 
663 aa  147  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
673 aa  147  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  27.67 
 
 
651 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 
692 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.67 
 
 
713 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0017  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.35 
 
 
635 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  25.38 
 
 
734 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 
553 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  25.65 
 
 
649 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  27.35 
 
 
682 aa  144  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 
654 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
583 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  26.16 
 
 
739 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  26.83 
 
 
690 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  28.23 
 
 
646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  26.13 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.72 
 
 
561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.44 
 
 
673 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 
670 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  30.48 
 
 
708 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 
613 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  24.91 
 
 
649 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 
613 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1068  penicillin-binding protein  28.04 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.3 
 
 
655 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  26.06 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  27.39 
 
 
638 aa  134  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  27.47 
 
 
656 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
702 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  27.9 
 
 
644 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 
579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.39 
 
 
571 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 
590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0768  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  26.12 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  26.52 
 
 
622 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
562 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  27.93 
 
 
663 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.91 
 
 
618 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.17 
 
 
689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 
729 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 
614 aa  130  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1115  penicillin-binding protein  32 
 
 
610 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  24.91 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 
710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  27.32 
 
 
631 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1671  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 
578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  29.03 
 
 
704 aa  127  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0136  penicillin-binding protein  27.94 
 
 
629 aa  127  5e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0702  penicillin-binding protein  29.93 
 
 
606 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  25.36 
 
 
727 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  27.26 
 
 
607 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  23.85 
 
 
721 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  23.85 
 
 
728 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.65 
 
 
682 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  28.01 
 
 
587 aa  123  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 
578 aa  123  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>