68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1621 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1621  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  686    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  33.77 
 
 
312 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  33.77 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  33.77 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  33.77 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  32.42 
 
 
261 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  33.44 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  33.44 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  33.44 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  33.44 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  33.44 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  33.44 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  31.74 
 
 
261 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  26.67 
 
 
238 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  24.61 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  24.53 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  24.61 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  24.61 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  24.84 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  23.97 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  23.97 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  24.21 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  25.59 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  24.62 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  23.81 
 
 
235 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  23.81 
 
 
302 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  23.28 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  24.53 
 
 
236 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  25.13 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  24.32 
 
 
237 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  27.13 
 
 
235 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  23.87 
 
 
236 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  24.53 
 
 
236 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  24.88 
 
 
224 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  26.29 
 
 
235 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  27.13 
 
 
235 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  22.4 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  23.64 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  23.64 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  23.64 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  23.64 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  25.12 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  23.87 
 
 
237 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  25.12 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  25.12 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  24.23 
 
 
235 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  23.28 
 
 
218 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  24.46 
 
 
213 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  25.81 
 
 
186 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  25.81 
 
 
186 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  22.83 
 
 
235 aa  43.1  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  22.51 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>