More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4986 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4986  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13578  putative hydrolase  68.14 
 
 
204 aa  301  6.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  64.53 
 
 
212 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202477  normal  0.468073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1536  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.14 
 
 
203 aa  253  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2939  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.65 
 
 
203 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0882  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.68 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1891  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  51.98 
 
 
203 aa  229  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2106  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.69 
 
 
203 aa  222  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0025  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  46.82 
 
 
219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.03 
 
 
218 aa  195  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0650  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.04 
 
 
218 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0663  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  45.05 
 
 
218 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8085999999999997e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3591  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  48.94 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000122928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0603  FAA hydrolase family protein  44.55 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3666  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  45.27 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2937  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.55 
 
 
218 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000218618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2369  hypothetical protein  43.39 
 
 
219 aa  174  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000473957  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1942  hypothetical protein  42.86 
 
 
218 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1999  hypothetical protein  41.84 
 
 
218 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00012789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2238  hypothetical protein  42.86 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000304661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2004  hypothetical protein  43.37 
 
 
218 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.394178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5292  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  44.79 
 
 
221 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1114  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  40.1 
 
 
219 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1185  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  44.79 
 
 
219 aa  168  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2468  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  43.09 
 
 
219 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2800  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.7 
 
 
219 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01155  predicted isomerase/hydrolase  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1280  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000019251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2445  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01165  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1666  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000638137  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1324  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1335  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00641682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1321  hypothetical protein  41.12 
 
 
219 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4850  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.27 
 
 
221 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2753  hypothetical protein  42.86 
 
 
218 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000267242  hitchhiker  0.000114559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2011  hypothetical protein  41.8 
 
 
219 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.517468  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1954  hypothetical protein  41.8 
 
 
219 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1969  hypothetical protein  43.09 
 
 
219 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000105527  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1505  hypothetical protein  41.8 
 
 
219 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1951  hypothetical protein  41.8 
 
 
219 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2118  hypothetical protein  42.35 
 
 
218 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0891763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2395  hypothetical protein  42.35 
 
 
218 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0911799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2007  hypothetical protein  42.35 
 
 
218 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0101882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01142  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.7 
 
 
222 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0299  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.24 
 
 
238 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1321  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.89 
 
 
230 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.45067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0330  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.75 
 
 
238 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1093  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.57 
 
 
202 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5385  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.44 
 
 
221 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5060  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.49 
 
 
221 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5153  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.49 
 
 
221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479206  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5206  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.24 
 
 
221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640418  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80437  fumarylacetoacetate hydralase  39.59 
 
 
231 aa  152  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0346038  normal  0.482803 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3169  FAA-hydrolase-family protein  39.8 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3907  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.8 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2637  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.24 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1199  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  41.41 
 
 
262 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.47 
 
 
208 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0063  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.6 
 
 
229 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  42.02 
 
 
208 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0062  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.6 
 
 
229 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0383  hypothetical protein  37.2 
 
 
233 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.588829 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01210  mitochondrion protein, putative  42.71 
 
 
228 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.490082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.62 
 
 
205 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1387  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.39 
 
 
208 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1535  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.89 
 
 
203 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0341155  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0073  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.39 
 
 
229 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4140  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.45 
 
 
232 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134832 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2951  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.33 
 
 
208 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.747988  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1403  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
208 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1426  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
208 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.768484  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1677  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.2 
 
 
231 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.800345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2078  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.2 
 
 
231 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2087  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.1 
 
 
224 aa  147  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0260  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  36.71 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1170  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.12 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0239  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  36.71 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1692  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.8 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1873  hypothetical protein  35.27 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4907  putative isomerase/hydrolase; putative Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.14 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128566  hitchhiker  0.00145889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48300  Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  40.98 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0312  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.18 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0233  hypothetical protein  39.6 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2815  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.33 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0332  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  40.21 
 
 
233 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0543  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.57 
 
 
225 aa  144  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0262694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4230  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.96 
 
 
232 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.81 
 
 
203 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal  0.0120347 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3945  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.68 
 
 
232 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58292  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0411  hypothetical protein  39.02 
 
 
221 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2628  putative fumarylpyruvate hydrolase (MhbH)  38.94 
 
 
232 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000129393  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4525  putative fumarylpyruvate hydrolase (MhbH)  38.94 
 
 
232 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.47 
 
 
232 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.684929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4514  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.47 
 
 
232 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0703423  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1689  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta- isomerase  38.83 
 
 
261 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0404  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  40.1 
 
 
297 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1336  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.18 
 
 
252 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1188  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40 
 
 
227 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.378742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1472  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40 
 
 
227 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>