More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4050 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4050  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.704104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4901  formyl transferase domain protein  30.62 
 
 
301 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0747809  normal  0.14631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  28.14 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  23.83 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  27.16 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  23.97 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  30.81 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  28.65 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  27.46 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3975  putative formyltransferase  27.16 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  29.95 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  26.57 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  28.83 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  27.47 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  26.24 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  29.44 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  26.27 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  26.1 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  25.71 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  25.8 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  27.05 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  25.71 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  25.63 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  28.38 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  25.63 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  26.18 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  28.17 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  25.63 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  25.21 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  26.5 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  23.94 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  27.93 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  27.84 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  23.81 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  23.48 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  25.88 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  26.22 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2467  methionyl-tRNA formyltransferase  26.88 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0926432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4591  putative formyltransferase  26.13 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00877136  hitchhiker  0.00199709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  30.16 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  30.53 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  24.15 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  25.62 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  26.37 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  24.51 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  28.16 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  25.99 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  25.84 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0924  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  23.81 
 
 
660 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68062 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  25.99 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  26.79 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  28.42 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  24.67 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  25.84 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  26.5 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2291  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  25.45 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0279  formyl transferase domain protein  25.94 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  23.77 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  24.48 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  27.37 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  24.1 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  28.17 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  24.48 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  22.88 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  27.36 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  24.07 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  25.2 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  24.07 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  24.07 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  25.49 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  24.07 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  28.97 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  23.65 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  25.1 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  23.47 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  25.73 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  22.95 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  24.48 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  29.19 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  24.81 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  25.47 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  29.76 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  29.76 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  25.23 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  27.76 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  26.11 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  30.91 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  24.48 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  25.24 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2400  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.2 
 
 
660 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>